理學院現在設有化學系、應用數學系、物理學系和資訊科學與工程學系等四系，以及資訊網路與多媒體研究所、統計學研究所和奈米科學研究所等3所，4系都設有大學部、碩士班及博士班，資訊科學與工程學系並設有碩士在職專班。 各系除了加強基礎與專門科學之教學外，並積極提昇理論與應用科學之研究成效。近年來不斷增添各系所之圖書及儀器設備，以供教學與研究之用。未來也將加強精英人才之培養、國內外學術合作與交流。重點發展智慧型資訊科學、數值計算與系統模型之軟體工程科學、奈米科技、生物物理、應用化學、藥物化學、生物感測器及光電材料等科學之研究。
